辛酉の歳（神武天皇元年・紀元前660年）の正月、磐余彦は橿原宮で践祚され、始馭天下之天皇（はつくにしらすすめらみこと）と称した。52歳であった。
神武天皇2年、功を定め、道臣命は築坂邑に大来目を畝傍山の西に居住させ、椎根津彦を倭国造に、弟猾を猛田邑の県主、弟磯城を磯城の県主に任じ、高皇産霊尊の子孫の剣根を葛城国造に任じた。併せて八咫烏を「幸を運ぶ鳥」と褒賞した。
神武天皇4年、天下を平定し海内無事を以て詔し、鳥見山に皇祖天神を祀った。
神武天皇31年、巡幸して、腋上の丘に登り、蜻蛉（あきつ）のとなめ（尾）に似ていることから、その地を秋津洲と命名した。
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神武天皇42年、皇后媛蹈鞴五十鈴媛命の皇子の神渟名川耳尊（かむぬなかわみみのみこと）を皇太子と定めた。
神武天皇76年、127歳にして崩御した。
父は彦波瀲武鸕鶿草葺不合命（ひこなぎさたけうがやふきあえずのみこと）、母は玉依姫命（たまよりひめのみこと）。
『古事記』・『日本書紀』本文・第一・第二・第四の一書では、四男。第三の一書のみ、三男と作す。なお生年月日の記述は記紀にはない。兄に五瀬命、稲飯命、御毛沼命がいる。